Благодаря Карлу союзники на один шаг приблизились к пониманию того, что из себя представляет вражеский секретный атомный проект под названием «Смертельный шторм». Карл отправляется в тщательно охраняемый Университет Нироли на контролируемом фашистами севере Италии, где он должен найти итальянского ученого, вынужденного работать на врага. «Смертельный шторм: проникновение» — это вторая из трех кампаний для 1–2 игроков, в которой Карл отправляется на опасное задание в тыл врага...